Ein Defekt in der mitochondrialen Fettsäuresynthese beeinträchtigt den Eisenstoffwechsel und führt zu erhöhten Ceramidspiegeln
Naturstoffwechsel (2023)Diesen Artikel zitieren
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In den meisten eukaryotischen Zellen findet die Fettsäuresynthese (FAS) im Zytoplasma und in den Mitochondrien statt. Der relative Beitrag von mitochondrialem FAS (mtFAS) zum zellulären Lipidom ist jedoch nicht genau definiert. Hier zeigen wir, dass der Funktionsverlust der mitochondrialen Enoyl-Coenzym-A-Reduktase (Mecr) von Drosophila, dem Enzym, das für den letzten Schritt von mtFAS erforderlich ist, Letalität verursacht, während der neuronale Verlust von Mecr zu einer fortschreitenden Neurodegeneration führt. Wir beobachten einen Defekt in der Fe-S-Cluster-Biogenese und einen erhöhten Eisenspiegel bei Fliegen, denen mecr fehlt, was zu erhöhten Ceramidspiegeln führt. Eine Reduzierung des Eisen- oder Ceramidspiegels unterdrückt die neurodegenerativen Phänotypen, was auf ein Zusammenspiel zwischen Ceramid- und Eisenstoffwechsel hinweist. Mutationen im menschlichen MECR verursachen eine Neurodegeneration, die bei Kindern auftritt, und wir zeigen, dass vom Menschen stammende Fibroblasten ähnlich erhöhte Ceramidspiegel und eine beeinträchtigte Eisenhomöostase aufweisen. Zusammenfassend identifiziert diese Studie eine Rolle von mecr/MECR im Ceramid- und Eisenstoffwechsel und stellt einen mechanistischen Zusammenhang zwischen mtFAS und Neurodegeneration her.
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Wir danken den betroffenen Personen und Familien, die an dieser Studie teilgenommen haben. Wir danken den Gutachtern für ihre Zeit und ihre aufschlussreichen Kommentare. Wir danken TM Dunn, D. Miller, SJ Hayflick, AJ Kastaniotis, MS Paul und H. Chung für hilfreiche Diskussionen, H. Pan und W.-W. Lin für Injektionen zur Erzeugung transgener Fliegen und J. Kim für MS-Analysen. Wir danken außerdem AJ Kastaniotis von der Universität Oulu für die Bereitstellung menschlicher Fibroblasten und N. Perrimon von der Harvard Medical School für die Bereitstellung von S2-Zellen. Wir danken F. Missirlis vom Center for Research and Advanced Studies des National Polytechnic Institute für den UAS-Fer1HCH- und UAS-Fer2LCH-Bestand. Wir danken außerdem dem Bloomington Drosophila Stock Center, dem Vienna Drosophila Resource Center und dem Kyoto Drosophila Genetic Resource Center sowie der Developmental Studies Hybridoma Bank der University of Iowa für die Bereitstellung von Fliegenbeständen und Reagenzien. Wir danken DD für die Unterstützung durch das Shan and Lee-Jun Wong-Stipendium des Baylor College of Medicine. Wir danken dem konfokalen Mikroskopiekern des Baylor College of Medicine Intellectual and Developmental Disabilities Research Center, unterstützt vom National Institute of Child Health & Human Development (U54 HD083092). ). HJB wird vom NIH Common Fund durch das Office of Strategic Coordination/Büro des NIH-Direktors unterstützt und das NINDS (U54NS093793), NIH/ORIP (24OD022005 und R24OD031447), ist Empfänger des Lehrstuhls des Neurological Research Institute of Texas Children's Krankenhaus und wird von der Huffington Foundation unterstützt. Der Inhalt liegt ausschließlich in der Verantwortung der Autoren und gibt nicht unbedingt die offiziellen Ansichten des NIH wieder.
Paul C. Marcogliese
Derzeitige Adresse: Abteilung für Biochemie und medizinische Genetik, Universität Manitoba, Winnipeg, Manitoba, Kanada
Eine vollständige Liste der Mitglieder des Undiagnostizierten Krankheitsnetzwerks und ihrer Zugehörigkeiten finden Sie in den Zusatzinformationen.
Abteilung für Molekular- und Humangenetik, Baylor College of Medicine, Houston, TX, USA
Debdeep Dutta, Oguz Kanca, Paul C. Marcogliese, Zhongyuan Zuo, Rishi V. Shridharan, Jun Hyoung Park, Guang Lin, Ming Ge, Benny A. Kaipparettu und Hugo J. Bellen
Jan und Dan Duncan Neurological Research Institute, Texas Children's Hospital, Houston, TX, USA
Debdeep Dutta, Oguz Kanca, Paul C. Marcogliese, Zhongyuan Zuo, Rishi V. Shridharan, Guang Lin, Ming Ge und Hugo J. Bellen
Abteilung für Labormedizin und Pathologie, Mayo Clinic, Rochester, MN, USA
Seul Kee Byeon & Akhilesh Pandey
Abteilung für pädiatrische Neurologie, Edmond and Lily Safra Kinderkrankenhaus, Sheba Medical Center, Ramat Gan, Israel
Gali Heimer
Die Sackler-Fakultät für Medizin, Universität Tel Aviv, Tel Aviv, Israel
Gali Heimer
Abteilung für Herz-Kreislauf-Medizin, Stanford University School of Medicine, Stanford, CA, USA
Jennefer N. Kohler und Matthew T. Wheeler
Manipal Academy of Higher Education, Manipal, Indien
Akhilesh Pandey
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Konzeptualisierung: DD und HJB Untersuchung: DD, OK, PCM, SKB, ZZ, JHP, RVS, GL, JNK, MTW, GH und MG Ressourcen: HJB, AP und BAK Schreiben, Originalentwurf: DD und HJB Schreiben, Überprüfung und Bearbeitung : DD, OK, PCM, GL, SKB, JNK, MTW, JHP, RVS, AP, BAK, GH und HJB Finanzierungseinwerbung: HJB Aufsicht: HJB
Korrespondenz mit Hugo J. Bellen.
Die Autoren geben an, dass keine Interessenkonflikte bestehen.
Nature Metabolism dankt Alexander Whitworth, Juan A Navarro und den anderen, anonymen Gutachtern für ihren Beitrag zum Peer-Review dieser Arbeit. Hauptredakteurin für Handling: Yanina-Yasmin Pesch, in Zusammenarbeit mit dem Nature Metabolism-Team.
Anmerkung des Herausgebers Springer Nature bleibt hinsichtlich der Zuständigkeitsansprüche in veröffentlichten Karten und institutionellen Zugehörigkeiten neutral.
(a) Mitochondrialer Fettsäuresyntheseweg und seine Produkte. Kurz gesagt werden eine Acetyl- und Malonyleinheit kondensiert, um eine vier Kohlenstoffe lange Keto-Acyl-Spezies zu bilden, die an das mitochondriale Acyl-Carrier-Protein (mtACP) gebunden bleibt, ein Protein, das die wachsende Acylkette während der Fettsäuresynthese in den Mitochondrien hält. Anschließend durchläuft dieses Ketoacyl-ACP mit vier Kohlenstoffatomen einen Reduktions-Dehydratisierungs-Reduktionszyklus, um ein Butyryl-ACP (C4) zu erzeugen. C4 tritt in den Zyklus ein und zwei Kohlenstoffatome der Malonyleinheit werden an die Butyrylspezies gebunden, um eine Acylkette mit einer Länge von sechs Kohlenstoffatomen zu bilden. Dieser Zyklus wird fortgesetzt, bis die Kohlenstofflänge der wachsenden Acylkette 16–18 Kohlenstoffatome erreicht. (b) Schema, das die in dieser Studie verwendeten mecr-Mutanten zeigt. (c) Schema, das die für die quantitative Echtzeit-PCR verwendeten Primer und die Diagramme zeigt, die die relativen Mengen an mecr-Transkripten in mecrTG4-Mutanten zeigen. Jeder Punkt stellt Daten aus drei technischen Replikaten dar. (d) Western Blot, der Liponsäure (LA)-Spiegel zeigt, die mit Muc (Ortholog von Hefe Lat1 und Bestandteil des PDH-Komplexes in Fruchtfliegen) und CG5214 (Ortholog von Hefe Kgd2 und Bestandteil des OGDH-Komplexes in Fruchtfliegen) in mecr-Mutanten verknüpft sind . (e) Auswirkungen eines Transgens, das mecr-GFP (Fosmid-Klon, CBGtg9060C0290D)36 enthält, oder der allgegenwärtigen Expression von HA-markiertem Fliegen-mecr auf homozygote mecrTG4-Mutanten. Für die statistischen Analysen wurde eine einfaktorielle ANOVA gefolgt von einem Tukey-Post-hoc-Test durchgeführt. Fehlerbalken repräsentieren SEM (****p < 0,0001).
Quelldaten
(a) Proteinausrichtungen von Mecr-Proteinen. Rote Kästchen zeigen die Aminosäurevarianten bei MEPAN-Patienten an. Das Schema zeigt die relative Position der Patientenvarianten im MECR-Protein. (b) Auswirkungen der allgegenwärtigen Expression menschlicher MECR-Varianten, wenn sie durch da-GAL4 in mecr-Mutanten gesteuert werden. (c) Prozentsatz der 15 Tage alten Fliegen, die innerhalb von 30 Sekunden 8 cm hochklettern können. Jeder Punkt stellt den Prozentsatz der Fliegen aus drei unabhängigen Experimenten dar. (d) Durchschnittliche Zeit, die 15 Tage alte Fliegen benötigen, um 8 cm zu klettern. Jeder Punkt repräsentiert die Zeit, die eine Fliege in jedem der drei Experimente benötigte. n = 93 (MECRRef), n = 86 (MECRArg258Trp), n = 84 (MECRGly232Glu) fliegt. Für die statistischen Analysen wurde eine einfaktorielle ANOVA gefolgt von einem Tukey-Post-hoc-Test durchgeführt. Fehlerbalken repräsentieren SEM (****p < 0,0001).
Quelldaten
(a, b) Western Blot (a) und Quantifizierung (b), die die relativen Konzentrationen des Mecr-Proteins beim neuronalen Knockdown (elav-GAL4) mit zwei verschiedenen RNAi-Linien bei 25 °C zeigen. Jeder Punkt repräsentiert die Daten aus drei unabhängigen Experimenten. Für statistische Analysen wird eine einfache ANOVA gefolgt von einem Dunnett-Mehrfachvergleichstest durchgeführt. Fehlerbalken stellen SEM dar (**p < 0,01). (c) Lebensdauer von Fliegen mit neuronalem Knockdown von mecr. (d) Prozentsatz der 25 Tage alten Fliegen, die innerhalb von 30 Sekunden 8 cm hochklettern können. Jeder Punkt stellt den Prozentsatz der Fliegen aus drei unabhängigen Experimenten dar. (e) Durchschnittliche Zeit, die 25 Tage alte Fliegen benötigen, um 8 cm zu klettern. n = 128 (luci-RNAi) und n = 55 (mecr-RNAi) Fliegen. Für statistische Analysen wird der zweiseitige Student-t-Test durchgeführt. Fehlerbalken repräsentieren SEM (*p<0,05; ****p < 0,0001). (f–h) Quantifizierung von ERG-Spuren von 3–5 Tage alten Fliegen. Jeder Punkt repräsentiert die Daten einer Fliege. n = 8 (Kontrolle und mecrA; GR), n = 10 (mecrA) fliegt. Für statistische Analysen wird eine einfaktorielle ANOVA gefolgt von einem Tukey-Post-hoc-Test durchgeführt. Fehlerbalken stellen SEM dar.
Quelldaten
(a) Expression von mCherry, angetrieben durch mecrKG4 (mecrKozak-GAL4, wobei wir die kodierende Region des Gens durch eine Kozak-Sequenz gefolgt von einem GAL4-Gen ersetzt haben) in Larvengehirnen. Elav-positive Zellen sind Neuronen und Repo-positive Zellen sind Gliazellen. (b) Expression von mCherry, angetrieben durch mecrKozak-GAL4 im erwachsenen Gehirn. Beachten Sie, dass die mecr-Expression im erwachsenen Gehirn spärlich ist. Einige wenige Zellen, einschließlich der potenziellen medialen Neuronen, die typischerweise insulinähnliche Peptide produzieren, exprimieren es jedoch reichlich. Maßstabsbalken 50 µm. (c) Kolokalisierung von Mecr-GFP und ATP5α im Larvenfettkörpergewebe des 3. Larvenstadiums. Maßstabsbalken 10 µm. (d) Kolokalisierung von menschlichem MECR und ATP5α in S2-Zellen. Maßstabsbalken 3,5 µm. Die Immunfärbung wurde unter Verwendung eines Antikörpers gegen menschliches MECR-Protein und eines Antikörpers gegen ATP5α durchgeführt. Alle Experimente wurden mindestens zweimal durchgeführt.
(a) Stammbaum der beiden Patienten mit MEPAN-Syndrom, die über das Undiagnostizierte Diseases Network identifiziert wurden. (b) RNA-Sequenz aus Blut, die bei beiden Patienten verringerte Mengen an MECR-Transkripten zeigt. (c–g) Relative Phospholipidspiegel in von MEPAN-Patienten stammenden Fibroblasten im Vergleich zu den von Eltern stammenden Kontrollfibroblasten: Phosphatidylcholin (PC), Phosphatidylethanolamin (PE), Phosphatidylinositol (PI), Phosphatidylserin (PS) und Phosphatidylglycerin (PG). Die Punkte stellen Werte technischer Replikate aus einem Satz biologischer Replikate dar. Für statistische Analysen wird eine einfaktorielle ANOVA gefolgt von einem Tukey-Post-hoc-Test durchgeführt. Fehlerbalken stellen SEM (*p < 0,05) (h–l) dar. Relative Konzentrationen verschiedener Phospholipide in den mecrTG4-Larven im Vergleich zur Kontrolle. Die Punkte stellen Werte technischer Replikate aus einem Satz biologischer Replikate dar (n = 350 Larven im 2. Stadium). Für statistische Analysen werden zweiseitige Student-t-Tests durchgeführt. Fehlerbalken repräsentieren SEM (*p < 0,05; ***p < 0,001).
Quelldaten
(a) Diagramm, das die Ceramidspezies in den mecrTG4-Larven zeigt. Die Daten werden als Mittelwerte +/− SEM dargestellt. (b) Diagramm, das die relativen Konzentrationen von Ceramidphosphoethanolamin (CPE) in den mecrTG4-Larven zeigt. Für statistische Analysen werden zweiseitige Student-t-Tests durchgeführt. Fehlerbalken stellen SEM dar (***p < 0,001). Für a und b stellen die Punkte Werte technischer Replikate aus einem Satz biologischer Replikate dar (n = 350 Larven im 2. Stadium). (c) Diagramm, das die Ceramidspezies in beiden Patientenfibroblasten zeigt. Die Punkte stellen Werte technischer Replikate aus einem Satz biologischer Replikate dar. Die Daten werden als Mittelwerte +/− SEM dargestellt.
Quelldaten
(a, b) Diagramme, die die Faltungsveränderungen bei verschiedenen Glucosylceramid-Spezies nach Behandlung mit Desipramin und Deferipron zum Zeitpunkt 15 und 25 Tage zeigen. Jedes Quadrat gibt den Durchschnittswert von drei technischen Replikaten an.
Quelldaten
(a) Relative Aktivität von ETC-Komplexen (CI-IV) in mecrTG4-Mutanten und Kontrollen. mecrTG4-Mutantenlarven zeigen eine verringerte Aktivität von Complex-I, I+III und IV und eine erhöhte Aktivität von Complex-II. Jeder Punkt stellt Daten von drei technischen Replikaten dar (n = 150 Larven im 2. Stadium). Für statistische Analysen werden zweiseitige Student-t-Tests durchgeführt. Fehlerbalken stellen SEM dar (**p < 0,01; ***p < 0,001****p < 0,0001). (b) Relative ATP-Spiegel in Fibroblasten von Patienten und elterlicher Kontrolle. Jeder Punkt repräsentiert die Werte aus vier Experimenten. Für statistische Analysen wird eine einfaktorielle ANOVA gefolgt von einem Tukey-Post-hoc-Test durchgeführt. Fehlerbalken stellen SEM dar (***p < 0,001). (c–e) Relative Sauerstoffverbrauchsraten in Kontroll- und patienteneigenen Fibroblasten, gemessen durch Seahorse-Analysen. (c) Basalatmung, (d) maximale Atmung und (e) freie Atemkapazität sind bei den vom Patienten stammenden Fibroblasten im Vergleich zu Fibroblasten, die aus der Elternkontrolle stammen, verringert. Jeder Punkt stellt die Werte der Replikate in jeder Vertiefung aus einem Satz biologischer Replikate dar. Für statistische Analysen wird eine einfaktorielle ANOVA gefolgt von einem Dunnett-Mehrfachvergleichstest durchgeführt. Fehlerbalken stellen SEM dar (*p < 0,05; **p < 0,01; ***p < 0,001). (f) Co-IP aus einem Satz biologischer Replikate zeigt die Interaktion zwischen NFS1 und ISCU in den Fibroblasten. Nach Durchführung einer Immunpräzipitation mit Maus-Anti-ISCU-Antikörper wurde der Blot auf NFS1 untersucht, entfernt und erneut auf ISCU geblottet.
Quelldaten
(a) Tabelle mit MEPAN-Patienten einschließlich Mutationen, Symptomen und Ferritinspiegeln im Blut. Von diesen sechs in der Tabelle beschriebenen Patienten wurde ein Patient (Patient III) bereits früher von Heimer et al.10 beschrieben. Bei den anderen fünf Patienten handelt es sich um neu identifizierte Personen, über die an keiner anderen Stelle berichtet wurde. (b) Diagramm, das die relativen ATP-Spiegel in Fibroblasten von Patient III im Vergleich zu den Fibroblasten von nicht verwandten Kontrollen zeigt. Jeder Punkt stellt die Werte der Replikate aus drei Experimenten dar. (c) Diagramm, das die relativen Eisenwerte in den Fibroblasten von Patient III zeigt. Jeder Punkt stellt die Werte der Replikate aus drei Experimenten dar. (d) Diagramm, das die relative Aconitase-Aktivität in den Fibroblasten von Patient III zeigt. Jeder Punkt stellt die Werte der Replikate aus drei Experimenten dar. Für statistische Analysen wird eine einfaktorielle ANOVA gefolgt von einem Tukey-Post-hoc-Test durchgeführt. Fehlerbalken stellen SEM dar (**p < 0,01).
Quelldaten
(a, b) Durchschnittlicher Prozentsatz (a) und Kletterzeit (b), um 8 cm von 25 Tage alten Fliegen mit neuronalem Knockdown von mecr (elav-GAL4>mecr-RNAi) und der Expression von Ferritinen zu erreichen. n = 81 (luci-RNAi), n = 76 (mecr-RNAi), n = 74 (mecr-RNAi und Fer1HCH-Fer2LCH) fliegt. (c, d) Durchschnittlicher Prozentsatz (c) und Kletterzeit (d) von 25 Tage alten Fliegen nach neuronalem (durch elav-GAL4) Knockdown von Mecr, behandelt mit und ohne eisenarme Nahrung sowie Deferipron. n = 62 (luci-RNAi), n = 155 (mecr-RNAi), n = 105 (mecr-RNAi mit eisenarmer Nahrung), n = 55 (mecr-RNAi mit Deferipron) Fliegen. Bei a und c stellt jeder Punkt den Prozentsatz der Fliegen aus mindestens drei unabhängigen Experimenten dar. Bei b und d stellt jeder Punkt die Zeit dar, die eine Fliege in mindestens drei unabhängigen Experimenten benötigt hat. (e) Relative Eisenmenge in den unbehandelten, mit Desipramin und Deferipron behandelten Fliegenköpfen mit neuronalem Abbau von mecr. Jeder Punkt repräsentiert die Werte von Replikaten aus drei Experimenten mit jeweils 25 Fliegenköpfen. (f) Co-IP zeigt die Interaktion zwischen Nfs1 und Iscu in den Fliegenköpfen mit neuronalem Knockdown von mecr. Für statistische Analysen wird eine einfaktorielle ANOVA gefolgt von einem Tukey-Post-hoc-Test durchgeführt. Fehlerbalken stellen SEM dar (***p < 0,001; ****p < 0,0001).
Quelldaten
Mitgliederliste des Undiagnostizierten Krankheitsnetzwerk-Konsortiums und ergänzende Abbildung 1 und Tabelle 1.
Statistische Quelldaten.
Statistische Quelldaten.
Statistische Quelldaten.
Statistische Quelldaten.
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Nachdrucke und Genehmigungen
Dutta, D., Kanca, O., Byeon, SK et al. Ein Defekt in der mitochondrialen Fettsäuresynthese beeinträchtigt den Eisenstoffwechsel und führt zu erhöhten Ceramidspiegeln. Nat Metab (2023). https://doi.org/10.1038/s42255-023-00873-0
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Eingegangen: 30. Oktober 2022
Angenommen: 21. Juli 2023
Veröffentlicht: 31. August 2023
DOI: https://doi.org/10.1038/s42255-023-00873-0
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